Page 111 - Revista de Citricultura Eureka! Noviembre 2021
P. 111

NOTAS TÉCNICAS





                       Identificación de estados inmaduros de plagas
                 cuarentenarias mediante q-PCR: aspectos técnicos y

                           moleculares de los kits utilizados en Chile

                               Diego von Bernath P., Claudio Navarro M. y Cristóbal Martínez B.*


                                                INBIO Soluciones Biotecnológicas
                                              *Correspondencia: cmartinez@inbio.cl


           Durante  la  presente  temporada  2021,  casi  por  finalizar   el uso de dos cebadores o partidores monohebra con
           a la  semana 38,  las exportaciones  chilenas de  cítricos   orientación 5’ a 3’ (notación utilizada para señalar los extremos
           alcanzan las 35.000 toneladas, con un 86% destinado al   de una hebra de ADN y para indicar la direccionalidad de
           mercado de Estados Unidos (ASOEX - EXPORDATA). En     la amplificación), y que permiten seleccionar la región de
           este contexto, se hace evidente la necesidad de contar con   ADN a amplificar. La técnica comprende además el uso de
           buenos sistemas de detección de estados inmaduros de   una enzima que tiene la capacidad de polimerizar ADN
           plagas cuarentenarias con el objetivo de evitar rechazos   y que es estable a altas temperaturas, siendo la proteína
           causados por problemas de identificación de especies.   más utilizada aquella aislada del microorganismo Thermus
           Algunas técnicas de biología molecular, tales como el PCR   aquaticus (Taq Polimerasa). Por otra parte, se denominan
           convencional y q-PCR (Deepak et al., 2007) se convierten en   marcadores moleculares aquellas regiones del ADN que son
           poderosas herramientas para la identificación de especies,   característicos de un grupo de individuos (especie, género,
           y en particular de estados inmaduros difíciles de identificar   familia, etc.) y que permiten su identificación, incluso
           morfológicamente, permitiendo reducir los rechazos en el   respecto a otras especies cercanamente emparentadas.
           programa de Pre Embarque SAG/USDA - APHIS/ASOEX.      Éstos son ampliamente usado en la identificación molecular,
                                                                 no solo en insectos sino que en la identificación de una gran
           Es por lo anterior que el Comité de Cítricos - ASOEX, impulsa   variedad de especies de virus, bacterias, insectos, plantas y
           con el apoyo de la Fundación para la Innovación Agraria   otros organismos superiores (Grover y Sharma, 2016).
           (FIA) y con el Instituto de Investigaciones Agropecuarias
           (INIA), como entidad investigadora, un proyecto  para   Dos de los marcadores moleculares más utilizados para
           desarrollar técnicas de PCR utilizando marcadores     la identificación molecular de especies de insectos, por
           moleculares para la identificación inequívoca de estados   la divergencia de su secuencia aún en especies muy
           inmaduros de curculiónidos, los cuales no son diferenciables   cercanas filogenéticamente, son las regiones intergénicas
           morfológicamente. Este  proyecto se suma al  proyecto   de los RNAs ribosomales, conocidas como ITS1 e ITS2, y
           INNOVA - CORFO, liderado por Fundación para el Desarrollo   la región de la citrocromo oxidasa I (COI). Ambos kits de
           Frutícola (FDF) para la identificación inequívoca de estados   identificación  utilizados  en  los  sitios  de  inspección  de
           inmaduros de algunas especies de Pseudocóccidos.      fruta fueron diseñados en la región ITS (Figura 1A) y se
                                                                 basan en la técnica de PCR en tiempo real o cuantitativo
           La reacción en cadena de la polimerasa (“Polymerase Chain   (qPCR por sus siglas en inglés) con sondas de hidrólisis
           Reaction”, PCR) corresponde a una técnica ampliamente usada   (ej:  TaqMan).  Particularmente  utilizan  una  variante  del
           en biología molecular para la generación de múltiples copias   qPCR-TaqMan en la que se puede analizar más de una muestra
           de regiones de ADN. En su versión tradicional, comprende   por pocillo (qPCR multiplex), para lo que se utilizan sondas






                                                                                                                      111
                                       REVISTA DE CITRICULTURA       2(2). 2021.
   106   107   108   109   110   111   112   113   114   115   116